Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCP1A6NGW2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCP1A6NGW2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms