Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HELTA6NFD8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms