Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM3A6NDB9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms