Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRT87PA6NCN2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms