Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POTEFA5A3E0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms