Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV30A0A0K0K1B3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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