Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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