Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RYR3Q15413 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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