Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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