Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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PKHD1P08F94 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKHD1P08F94 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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