Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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GRIK4Q16099 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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GRIK4Q16099 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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GRIK4Q16099 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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GRIK4Q16099 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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GRIK4Q16099 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GRIK4Q16099 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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