Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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