Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 EIF4BP4-201ENST00000441847 1780 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZNF610-207ENST00000601151 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXA2O43364 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms