Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CSE1L-AS1-201ENST00000417781 556 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CLK1-201ENST00000321356 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TRIM49D1-201ENST00000420869 1651 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TRIM49D2-202ENST00000623787 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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