Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TAF11Q15544 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TAF11Q15544 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TAF11Q15544 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TAF11Q15544 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TAF11Q15544 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms