Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CADM1Q9BY67 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms