Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
NEDD1Q8NHV4 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms