Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LAMA1-201ENST00000389658 9657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CSMD1-202ENST00000400186 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HERC1Q15751 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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