Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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RYR3Q15413 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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RYR3Q15413 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RYR3Q15413 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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