Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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