Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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SH3BP1Q9Y3L3 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SH3BP1Q9Y3L3 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SH3BP1Q9Y3L3 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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SH3BP1Q9Y3L3 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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SH3BP1Q9Y3L3 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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