Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDH18Q13634 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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