Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GPS1Q13098 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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