Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GTF3C6Q969F1 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms