Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ITGA7Q13683 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms