Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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IFT88Q13099 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
IFT88Q13099 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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