Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 SCMH1-210ENST00000402904 3204 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LRRC37A17P-201ENST00000570311 4693 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC024132.1-201ENST00000382007 2509 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 AC008738.6-201ENST00000604605 569 ntTSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ZNF567-204ENST00000588311 2042 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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