Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
FOXQ1Q9C009 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms