Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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GRIK4Q16099 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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GRIK4Q16099 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
GRIK4Q16099 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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