Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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