Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF330Q9Y3S2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF330Q9Y3S2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms