Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOP58Q9Y2X3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOP58Q9Y2X3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms