Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP20Q9Y2K6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP20Q9Y2K6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms