Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA1024Q9UPX6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KIAA1024Q9UPX6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KIAA1024Q9UPX6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms