Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP18Q9UMW8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP18Q9UMW8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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