Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMCC3Q9ULS5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms