Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC42EP3Q9UKI2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms