Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TNIKQ9UKE5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNIKQ9UKE5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.5 ms