Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
VPS51Q9UID3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms