Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN11AQ9UI33 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN11AQ9UI33 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms