Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPN3Q9UHW5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms