Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP25Q9UHP3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms