Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC6Q9UBN7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms