Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CC2D2AQ9P2K1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms