Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC88CQ9P219 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms