Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL20A1Q9P218 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL20A1Q9P218 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
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