Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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