Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms