Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNIP1Q9NZI2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms