Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC10Q9NYD6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC10Q9NYD6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms